Aujourd’hui, ce sont des chevaux de loisirs ou bien des chevaux de travail qui accomplissent leur service avec calme et sérénité. Ils acceptent volontiers de développer une relation avec les humains. Il est utile d’être constamment en conversation avec le cheval. La langue utilisée est sans importance. Même ceux qui ne parlent pas « cheval » sont compris, le son de la voix porte le fil de l’amitié. Depuis 1919, il existe également une association des chevaux comtois (Association Nationale du Cheval de Trait Comtois) qui s’occupe de l’élevage et de la promotion de la race comtoise. Cela était urgent, sinon le Comtois se serait perdu dans la masse des croisements sauvages. De nos jours, les Comtois sont utilisés presque partout comme chevaux de loisirs et de travail. Le Comtois peut servir pour l’équitation, la traction, et même pour le ramassage des ordures et le transport scolaire.